蛋白质工程文库的新黄金标准

最近，Twist Bioscience 文库产品经理 Lucy Xu 在网络研讨会上概述了 Twist 如何构建新的基因突变文库：“使用 Twist Bioscience 的 SOLD 文库来探索序列空间”。该网络研讨会是在 Twist Bioscience 的新产品 —— Spread Out Low Diversity (SOLD) 文库发布之后进行的。Lucy 讨论了 Twist 文库产品系列的这一新增功能是如何针对于酶进行蛋白质工程开发的，提供了一种工具来快速准确地设计，研究和优化酶活性、蛋白质稳定性或溶解性。

借助硅的力量重新改写 DNA

Twist Bioscience 开发了专有技术，可以在硅平台上合成 DNA。该平台可最大程度地缩短合成过程，允许以与 96 孔板相同的形状因子印刷多达一百万个寡核苷酸。

这些寡核苷酸为许多 Twist 产品的奠定了基础。“我们利用我们的技术，以快速并廉价的方式构建了 DNA 基因突变文库，因此您可以在短短两周内便可获得所需的工具。”Lucy 评论说。通过访问大量的高质量寡核苷酸，每个变异株都是在逐个的基础上建立起来的，因此可以将多样性精确地整合到关注区域中。该技术的应用包括蛋白质工程、抗体工程和酶进化等。

SOLD 是多位点组合基因突变文库的扩展

到目前为止，Twist Bioscience 提供了两种基因突变文库产品：定点饱和基因突变文库 (SSVL) 和 组合基因突变文库 (CVL)。在 SSVL 中，每个序列代表特定位置的单个氨基酸变异。关注蛋白中的每个氨基酸都可以变异为其他氨基酸。如需要，还可以表示特定氨基酸的精确比例。在 CVL 中，可以探索多个位置的氨基酸变异株的完整组合集。因此，可以在较短的蛋白质序列中探索大量的序列空间。

Lucy 解释了 Twist Bioscience新推出的 SOLD 文库是如何弥合 SSVL 和 CVL 之间的鸿沟的，这是专门为客户研究分散在其关注基因中的多个变异位置而专门设计的。

借助 SOLD 文库，研究人员可以：

• Build multiple libraries of up to 108 diversity each.
• 通过精确设计跨野生型序列的多个变异来构建文库，快速有效地研究并优化蛋白质活性，该变异可分散在整个蛋白质中或被定位在特定域。
• 将长度变化合并到文库中。

SOLD 文库客户还可以获得支持，从而删除了文库中的责任、非特异性基序、和任何其他无需特性，从而丰富了更可能成功的变异株。

SOLD 文库的蛋白质工程

相对于随机诱变、定向诱变和基于“DNA 改组”的酶工程方法，SOLD 文库提供了巨大的改进，因为只有精确设计的变异才会被整合到蛋白质中。SOLD 文库还允许每个氨基酸在每个位置的均匀分布，并摒除不需要的偏倚。

Check out the webinar recording to see how Twist built a SOLD library with 26 variant positions scattered throughout the protein, each position containing 2-3 mutations, including the wild type amino acid. Specifically, you will see how the SOLD library synthesis process preserves diversity without being restricted by codon bias. You will also see how the amino acid distribution matches the original design without the need for additional screening with no unintended mutations and no dropouts!

有关 SOLD 文库的更多信息，请一定查看产品页面。

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