Panel de investigación de virus respiratorios

Compiladas de la base de datos de GenBank, las 41 047 sondas de este panel permitirán a los investigadores separar los síntomas de la COVID-19 de los de otras enfermedades respiratorias, tanto relacionadas con la gripe como no relacionados. El panel respiratorio Twist permite el enriquecimiento de estas secuencias virales para la secuenciación de última generación (NGS) de alta resolución. Esto permite una detección de alta sensibilidad de tan solo 100 copias de material viral con un enriquecimiento superior a 5000x incluso en muestras complejas y una cobertura >99,9 % del genoma a un postenriquecimiento 1X o mayor.

A cada control viral sintético Twist se le añadieron 50 ng de ARN de portador humano a 1.000.000 copias antes de la síntesis de ADNc. Para cada estándar, mostramos el porcentaje de lecturas virales en el objetivo, el enriquecimiento con respecto a la entrada, la cobertura media del genoma, el porcentaje de bases con una cobertura de al menos 30x y la longitud de la plantilla. Los genomas virales se ordenan por longitud del molde (del más pequeño al más grande) entre todos los segmentos de genoma. En la mayoría de los casos, se determinó que más del 70 % de las lecturas provenían de genomas virales de estas bibliotecas, que representaban al menos un enriquecimiento 2500x con respecto al contenido agregado.

Una comparación del porcentaje de lecturas virales en el objetivo capturadas mediante los controles virales sintéticos Twist a diferentes títulos virales mediante una reacción de hibridación multiplexada y monoplexada. El primer gráfico muestra comparaciones utilizando una reacción de hibridación multiplexada y monoplexada con 1 000 000 de copias por biblioteca, mientras que el segundo gráfico muestra una comparación similar con 100, 10 000 y 1 000 000 copias por biblioteca. Todos los controles virales se capturaron con el flujo de trabajo de enriquecimiento del objetivo Twist estándar y el panel de investigación de virus respiratorios Twist. Estos datos demuestran que una captura 8-plexada proporciona un enriquecimiento eficiente comparable a una captura monoplexada cuando se utiliza el panel de investigación de virus respiratorios Twist.

El panel de investigación de virus respiratorios Twist incluye acceso a la herramienta basada en la nube One Codex. Ideal para la investigación y el uso clínico, puede utilizarse para crear visuales listos para su publicación e informes imprimibles para laboratorios que estén preparando pruebas desarrolladas para laboratorios.

Cuando utilice el panel de investigación de virus respiratorios Twist, la plataforma de análisis One Codex estará accesible para todos los clientes. Esta plataforma es ideal para casos de investigación y de uso clínico, lo que incluye la producción de visuales listos para publicar, informes de uso compartido y otras herramientas de análisis. Cuando adquiera el panel, se le proporcionarán instrucciones de incorporación y créditos para análisis de muestras en la plataforma One Codex. Dispone de más información sobre esta solución de análisis de muestras microbianas en One Codex.