l’amélioration de la santé humaine
L'épigénétique est l'étude de l'impact de l'environnement sur l'expression des gènes par le biais de modifications de l'ADN qui n'altèrent pas la séquence du génome. Au contraire, les modifications chimiques comme la méthylation et l'acétylation ont un impact sur plusieurs facteurs, notamment le repliement de la chromatine, la liaison des histones, l'activité des effecteurs et l'efficacité des promoteurs. Les modifications de l'épigénome sont liées à des effets néfastes sur la santé et constituent un facteur de risque sous-jacent connu pour le cancer et d'autres maladies complexes. L'identification de nouvelles caractéristiques épigénétiques des maladies et le dépistage des marqueurs épigénétiques connus revêtent une importance capitale pour l'amélioration de la santé humaine.
Vous voulez en savoir plus sur les solutions innovantes de Twist pour l’analyse de méthylation par séquençage ? Consultez l’e-book « Séquençage de la méthylation dans la détection du cancer. »
Twist prend en charge l'analyse épigénétique
Un flux de travail complet pour l’analyse de méthylation par séquençage, notamment la conversion enzymatique permettant de capturer jusqu'à 15 % de cytosines méthylées en plus
Des panels d'enrichissement ciblé personnalisés pour une capture précise et uniforme des régions d'intérêt impliquées dans l'épigénétique.
Banques très uniformes de longs oligos alimentant des essais génomiques fonctionnels massivement parallèles pour interroger l'expression des gènes
Les avantages de la conversion enzymatique dans les flux de travail d’analyse de méthylation par séquençage
Alors que la plupart des méthodes reposent sur la conversion au bisulfite de l'ADN pour détecter les cytosines non méthylées, le traitement au bisulfite nécessite des températures élevées et un pH agressif qui peuvent endommager l'ADN, ce qui est particulièrement difficile avec des échantillons de petite taille ou des types d'échantillons déjà fragiles.
Avec le Twist NGS Methylation Detection System, vous pouvez sauver des molécules d'ADN et bénéficier d'une couverture génomique uniforme de plus de régions d'ADN en utilisant une méthode de conversion enzymatique. Cette méthode vous permet de détecter jusqu'à 15 % de cytosines méthylées en plus, ce qui augmente la confiance dans les appels de bases méthylées pour l'étude de l'épigénétique.
Le séquençage ciblé de l’épigénomique de l’ADN acellulaire peut améliorer la sensibilité du dépistage précoce du cancer
Gahee Park, PhD, de l'Université de Cambridge, explique comment les changements de méthylation de l'ADN sont des marqueurs fiables spécifiques au cancer, et comment le Twist NGS Methylation Detection System a aidé son équipe à tripler la précision de l'enrichissement, tout en divisant par quatre les coûts expérimentaux.
Des analyses massivement parallèles utilisant un gène rapporteur permettent d'élucider les facteurs génétiques responsables de l'expression des gènes.
Sans une compréhension détaillée des éléments qui modifient l'expression des gènes par des moyens épigénétiques, les informations cliniquement pertinentes codées dans le volume croissant de données génétiques resteront inconnues.
Les chercheurs utilisent des analyses de rapporteurs massivement parallèles utilisant un gène rapporteur (MPRA) pour interroger les éléments régulateurs à haut débit.
Les oligos longs Twist alimentent les MPRAs
Notre plateforme en silicone nous permet de générer rapidement des banques MPRA importantes, précises et très uniformes, composées d'oligonucléotides d'une longueur allant jusqu'à 300 paires de bases.
Ces banques présentent de nombreux avantages :
- La synthèse précise d'oligonucléotides vous permet d'avoir confiance dans vos résultats et de savoir que la séquence d'ADN que vous concevez est la séquence que vous testerez.
- Grâce à leur uniformité élevée, les éléments surreprésentés ou sous-représentés ne présentent aucun biais et n'alourdissent pas la charge de travail du dépistage.
- L'accès à de longues banques d'oligonucléotides permet de mettre en place des codes-barres sans pour autant renoncer à la séquence d'intérêt.
- Les oligonucléotides longs signifient également qu'une plus grande partie du contexte génétique naturel peut être codée, ce qui permet des analyses plus précises sur le plan biologique.
Analyse épigénétique : un outil prometteur pour la détection précoce du cancer
La méthylation de l'ADN est une modification épigénétique qui peut avoir un impact sur l'expression des gènes, et certains schémas de méthylation anormaux ont montré une corrélation avec le cancer. Si de nombreux chercheurs travaillent à la mise au point de tests permettant d'identifier plusieurs cancers à partir d'un seul échantillon de sang, cette tâche reste complexe. Le Twist NGS Methylation Detection System permet toutefois de relever ces défis. Grâce à sa capacité unique à générer rapidement un grand nombre de sondes oligonucléotidiques, Twist est en mesure de simplifier la déconvolution et de réduire les biais tout en conservant une grande sensibilité à l'ADN peu abondant.
