是否有兴趣与我们合作?
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概述
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概述 

Twist Alliance 组合简介——与领先科学机构合作设计的精选高质量靶向富集组合。

Twist Alliance 组合结合了 Twist 世界级的寡核苷酸合成平台与我们科学合作伙伴深度的领域专业知识,可提供现成的组合,助力您加快研究进度。在专家已经为您完成工作的情况下,为什么还要花时间来设计组合?

与我们携手合作

您是否有兴趣构建一个 Twist Alliance 组合产品组合中所没有的组合?

与我们携手合作,实现商业化

 

概述 

Twist Alliance 组合简介——与领先科学机构合作设计的精选高质量靶向富集组合。

Twist Alliance 组合结合了 Twist 世界级的寡核苷酸合成平台与我们科学合作伙伴深度的领域专业知识,可提供现成的组合,助力您加快研究进度。在专家已经为您完成工作的情况下,为什么还要花时间来设计组合?

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探讨我们的组合

Twist Alliance 组合旨在为您提供一个良好的开端,汇集多学科专业知识,实现卓越的靶向富集,适用于从癌症诊断到载体筛选的各种应用。如果所有组合看起来都非常适合您的需求,每个组合都可根据您的需求定制。您是否有兴趣同我们合作,实现新的组合的商业化?联系我们。帮助您跳过设计、建造、测试、学习周期。

Twist Alliance 多样性 SNP 组合

历史基因分型工具的一个普遍问题在于它们偏向于少数族裔,使得人类的很大一部分在测序基因分型 (GBS) 工作流程中的代表性不足。例如,微阵列平台仅提供偶尔更新的内容,更加剧了这一挑战。

研究人员可以通过利用基于靶标捕获的 NGS 工作流程来解决这些低效和不公平问题,该工作流程的探针组合旨在实现多样性和灵活性。

作为 Twist 不断增长的靶向 GBS 产品组合的一部分,Twist 多样性 SNP 组合为研究人员提供了一种全新、灵活、不分种族的金标准,可用于 GBS。

科学家可以自由地使用该组合作为一种独立的基因分型组合,或添加到 Twist 人全面外显子组组合中。其设计也可定制——可在 Twist 的 DNA 合成平台上合成涵盖目标区的额外探针。

Twist 多样性 SNP 组合的内容与 Regeneron 遗传学中心的领导合作策划。该组合旨在整合到现有的全自动化外显子组处理工作流中,提供基本调用和估算变量。

可以使用可用的开源工具计算基因分型。如需获得开始使用插补分析工具的插补指南,请联系客户支持部
 

注:Diversity SNP 组合内容尚未通过完整的 Twist 工作流进行充分验证。有关检测设置的建议,请联系 Twist 客户支持部。

探针

640k

覆盖的 SNP

1.4M

灵敏度

插补大多数变异株,直至 MAF 为 0.1% 或以下

订购信息

104374

Twist 多样化 SNP 组合,2 次反应

104375

Twist 多样化 SNP 组合,12 次反应

104376

Twist 多样化 SNP 组合,96 次反应

104393

Twist 多样化 SNP 组合,16 个样本,采用标准杂交的完整试剂盒

104394

Twist 多样性 SNP 组合,96 个样本,采用标准杂交的完整试剂盒

Twist Alliance 泛癌症甲基化组合 - 1.5 MB

甲基化测序作为一种灵敏的工具,可检测和追踪癌细胞来源。但同任何测序项目一样,需要权衡覆盖的广度和深度。如果您准备好关注癌症特异性甲基化模式,就可使用本组合。AnchorDx 的专家同 Twist 合作,创建了一个定制的靶向富集组合,专门关注与 31 种不同癌症相关的靶标。

Twist Alliance 泛癌症甲基化组合 - 1.5 MB 可深度覆盖临床重点靶标,可用于研究可能与肿瘤和液体活检样本的早期癌症检测和诊断相关的甲基化模式。该组合与 AnchorDx 的专家合作设计,并采用 Twist 世界级的寡核苷酸合成平台构建,具有较高的中靶率和高度均一性,并且采用乳腺癌、结直肠癌和非小细胞肺癌的液体活检样本,通过 Twist 甲基化工作流程进行了验证。

 

组合设计

  • 31 种癌症类型、47 个疾病实体,基于 TCGA 数据库
  • 13,090 个探针 
  • 涉及 126k 个 CpG 位点
  • 约 12k 个差异性甲基化区域 (DMR)
  • 12k 中有 9k (74%) 与 CpG 岛重叠

注:Twist Alliance 泛癌症甲基化组合 - 1.5 MB 未获得 ISO-13485 认证

订购信息

104694

Twist Alliance 泛癌症甲基化组合 - 1.5 MB,2 次反应

104695

Twist Alliance 泛癌症甲基化组合 - 1.5 MB,12 次反应

104696

Twist Alliance 泛癌症甲基化组合 - 1.5 MB,96 次反应
Twist 甲基化工作流程

101976

NEBNext® EM-seq™ 试剂盒,用于 Twist 靶向甲基化测序,96 个样本*

103557

Twist 甲基化促进剂,12 次反应

100578

Twist 通用封闭剂,12 次反应

100983

Twist 结合和纯化磁珠试剂盒,12 次反应

101174

Twist 快速杂交和洗脱试剂盒,12 次反应

103496

Twist 靶向甲基化测序工作流程,96×12 次反应

*还提供 2 次反应和 12 个反应大小用于富集

Twist Alliance 临床研究外显子组 - 34.9 MB

Twist Alliance 临床研究外显子组帮助支持博德研究所基因组学平台,并采用经验证的、来自临床患者样本的数据进行设计。该组合利用了 Twist 灵活的 NGS 平台,可轻松、快速地定制内容,最终对外显子组进行全面调查,并补充丰富了与癌症以及罕见和遗传性疾病相关的基因组临床相关区域。该检测具有 Twist NGS 探针出众的均一性,可降低每个样本的成本和提高通量效率,迄今为止,博德研究所已利用该检测处理了超过 250,000 个样本,保持了其在外显子组测序方面的领先地位。

该组合的全面设计包括 Twist 核心外显子组、线粒体基因组和额外经过验证的编码和非外显子目标区域(如 ACMG73 基因)、来自 OMIM 和 COSMIC 的补充区域覆盖度,以及博德研究定义的特异性靶标。

注:Twist Alliance 临床研究外显子组 - 34.9 MB 内容已通过完整的 Twist 工作流程进行充分的验证。有关检测设置的建议,请联系 Twist 客户支持部。

注:Twist Alliance 临床研究外显子组 - 34.9 MB 未获得 ISO-13485 认证。

 

订购信息

104032

Twist Alliance 临床研究外显子组,34.9 MB,2 次反应试剂盒

104033

Twist Alliance 临床研究外显子组,34.9 MB,12 次反应试剂盒

104034

Twist Alliance 临床研究外显子组,34.9 MB,96 次反应试剂盒

Twist Alliance VCGS Exome - 40.1 MB

在常规检测未能提供诊断的情况下,医生通常会求助于 DNA 测序组合来寻求答案,尤其是当怀疑存在遗传性疾病时。但如果无专家指导,可能难以知道哪个组合才是合适的组合。
Victorian Clinical Genetics Services (VCGS) 凭借几十年的临床基因组学经验,与 Twist 合作设计了一种诊断组合——Twist Alliance VCGS Exome - 40.1 MB,可覆盖整个外显子组,专门覆盖临床相关基因 (Mendeliome)。在设计该组合时,特别注意确保临床相关位点的额外覆盖度,这些位点不属于外显子组传统靶向的基因编码区(即非编码区中的已知致病位点)。
Twist Alliance VCGS Exome - 40.1 MB 组合是一种出众、且具有高度均一性的组合,有助于简化遗传性疾病相关等位基因的识别,无论是通过载体筛选还是产前和产后检测。

注:Twist Alliance VCGS Exome - 40.1 MB 内容已通过完整的 Twist 工作流程进行充分的验证。有关检测设置的建议,请联系 Twist 客户支持部。

注:Twist Alliance VCGS Exome - 40.1 MB 未获得 ISO-13485 认证。

探针总数

425.4K

包括 Twist 综合外显子组

394.1K 个探针

和 VCGS 设计的内容

31.3K 个探针

订购信息

104282

Twist Alliance VCGS Exome - 40.1 MB,2 次反应试剂盒

104283

Twist Alliance VCGS Exome - 40.1 MB,12 次反应试剂盒

104284

Twist Alliance VCGS Exome - 40.1 MB,96 次反应试剂盒

Twist Alliance 犬外显子组 - 40.5 Mb

仅供研究使用,不适用于诊断程序

了解犬种之间的遗传变异对于了解性状的遗传调控及犬类疾病基础和病情发展至关重要。因此,外显子组等全方位基因组合是改善兽医诊断及相关临床医学的关键。这些类型的 NGS 组合还将加速研究进程,更深入地了解犬类癌症及可能的疗法。

我们与 Broad Institute 的 Karlsson 试验室合作开发了 Twist Alliance 犬外显子组,为犬类基因组学研究提供了合适的工具。此外,还发现人类和犬类肿瘤之间存在基因相似性,如 CNV、差异基因表达和结构染色体异常 1,因此犬类基因组研究对人类医学研究也有好处。

Twist Alliance 犬外显子组组合的设计考虑了以下目标

  1. 包括犬类基因的编码外显子
  2. 实现犬类与人类基因组之间的比较研究
  3. 包括人类癌症中已知的重要领域
  4. 实现高性价比的深入测序

这个组合包含超过 17k 个基于 CanFam3.1 的基因/靶标,另外还包括与犬类癌症有关的基因/靶标。

基因

相关
COSMIC
突变

基因 相关
COSMIC
突变
基因 相关
COSMIC
突变
ABL1 19 HRAS 26 TET2 16
AKT1 6 MPL 0 FAS 3
ERBB2 19 SMAD4 31 STAT5B 4
GNAS 12 ATM 24 DNMT3A 6
MET 18 FBXW7 25 STAT3 6
RB1 18 IDH1 15 CREBBP 9
CCR4 3 NOTCH1 20 RHOA 1
MYC 5 SMARCB1 11 CHEK2 5
EGFR 123 BRAF 77 PRDM1 6
GNAQ 6 FGFR1 2 CDKN2A 108
KRAS 63 IDH2 12 FGFR3 17
PTPN11 28 NPM1 28 JAK3 6
CD28 3 SMO 5 PDGFRA 26
PLCG1 3 CDH1 7 STK11 22
ALK 8 FGFR2 8 CTNNB1 73
ERBB4 13 JAK2 5 GNA11 5
HNF1A 10 NRAS 35 KIT 139
MLH1 1 SRC 1 PTEN 146
RET 17 JAK1 12 VHL 124
APC 164 IL7R 4 CSF1R 8
EZH2 11 IL2RG 3 FLT3 30
TP53 1087 TNFAIP3 9 KDR 11
FYN 3 PIK3CA 97    


上表显示了 50 个这样的靶标,以及与其中各个基因相关的 COSMIC 突变 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5978258/) - 这些基因采用 2 倍平铺密度来获得更高覆盖度。FOXA1 和 TERT 启动子采用 4 倍平铺密度。按照我们的标准做法,所有其他区域采用 1 倍平铺密度。

有了世界领先的犬癌症研究人员精心策划的内容加上 Twist 强劲的组合表现,Twist Alliance 犬外显子组为研究人员研究犬类疾病和人类罕见病提供了最理想的工具。

1 Overgaard,N.H.,Fan,T.M.,Schachtschneider,K.M.,Principe,D.R.,Schook,L.B.,& Jungersen, G. (2018). Of Mice, Dogs, Pigs, and Men: Choosing the Appropriate Model for Immuno-Oncology Research. ILAR journal, 59(3), 247–262.

注:Twist Alliance 犬外显子组 - 40.5 MB 未获得 ISO-13485 认证。

订购信息

105305

Twist Alliance 犬外显子组 - 40.5 Mb,2 次反应试剂盒

105306

Twist Alliance 犬外显子组 - 40.5 Mb,12 次反应试剂盒

105307

Twist Alliance 犬外显子组 - 40.5 Mb,96 次反应试剂盒