联盟组合
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概述
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概述 

Twist 联盟组合简介——与领先科学机构合作设计的高质量靶向富集精选组合。

Twist 联盟组合集成了 Twist 一流的寡核苷酸合成平台以及科学合作伙伴深厚的领域专业知识,可提供现成的组合,助您加快研究进展。在专家已经为您完成工作的情况下,为什么还要花时间来设计组合?

与我们携手合作

您是否有兴趣构建一个 Twist 联盟组合产品中所没有的组合?

与我们携手合作,实现商业化

 

概述 

Twist 联盟组合简介——与领先科学机构合作设计的高质量靶向富集精选组合。

Twist 联盟组合集成了 Twist 一流的寡核苷酸合成平台以及科学合作伙伴深厚的领域专业知识,可提供现成的组合,助您加快研究进展。在专家已经为您完成工作的情况下,为什么还要花时间来设计组合?

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探索我们的组合

Twist 联盟组合旨在为您提供一个良好的开端,汇集多学科专业知识,实现卓越的靶向富集,适用于从癌症诊断到载体筛选的各种应用。如果所有组合看起来都不太符合您的需求,则可以定制任何组合,根据您的需求扩大覆盖度。您是否有兴趣同我们合作,实现新组合的商业化?联系我们。帮助您跳过设计、构建、测试、学习周期。

Twist 联盟多样性 SNP 组合

历史基因分型工具的普遍问题之一是它们偏向于少数种族,使得大部分人类在经典基因分型工作流程中的代表性不足。例如,微阵列平台仅提供偶尔更新的固定内容,更加剧了这一挑战。

研究人员可以通过基于靶标捕获的 NGS 工作流程以及专为多样性和灵活性而设计的探针组合,来解决这些低效和不公平问题。

作为 Twist 不断成长的靶向 GBS 产品组合的一部分,Twist 多样性 SNP 组合为研究人员提供了一种全新、灵活、无种族偏向性的金标准,可用于 GBS。

科学家可以自由地使用该组合作为一种独立的基因分型组合,或添加到 Twist 人 全面外显子组组合中。其设计也可定制——可在 Twist 的 DNA 合成平台上合成涵盖目标区域的额外探针。

Twist 多样性 SNP 组合的内容是与 Regeneron 遗传学中心的领导者合作策划。该组合旨在整合到现有的全自动化外显子组处理工作流程中,实现碱基识别和突变填充。

基因型填充可以借助可用的开源工具进行计算。如需获取填充指南以开始使用填充分析工具,请联系客户支持
 

注:多样性 SNP 组合内容尚未通过完整的 Twist 工作流程进行充分验证。请联系 Twist 客户支持,获取关于检测设置的建议。

探针

640k

覆盖的 SNP

1.4M

灵敏度

填充大多数突变,直至 MAF 为 0.1% 或更低

订购信息

104374

Twist 多样化 SNP 组合,2 次反应

104375

Twist 多样化 SNP 组合,12 次反应

104376

Twist 多样化 SNP 组合,96 次反应

104393

Twist 多样化 SNP 组合,16 个样本,采用标准杂交的完整试剂盒

104394

Twist 多样化 SNP 组合,96 个样本,采用标准杂交的完整试剂盒

Twist 联盟泛癌种甲基化组合 - 1.5 MB

甲基化测序作为一种灵敏的工具,可检测和追踪癌细胞来源。但同任何测序项目一样,需要权衡覆盖的广度和深度。如果您准备专注于癌症特异性甲基化模式,则可使用本组合。AnchorDx 的专家同 Twist 合作,创建了定制的靶向富集组合,针对于 31 种不同癌症的相关靶标。

Twist 联盟泛癌种甲基化组合 - 1.5 MB 可深度覆盖临床重点靶标,可用于研究可能与肿瘤和液体活检样本的早期癌症检测和诊断相关的甲基化模式。该组合与 AnchorDx 的专家合作设计,并采用 Twist 一流的寡核苷酸合成平台构建,具有较高的中靶率和高度均一性,并且采用乳腺癌、结直肠癌和非小细胞肺癌的液体活检样本,通过 Twist 甲基化工作流程进行了验证。

 

组合设计

  • 31 种癌症类型、47 个疾病实体,基于 TCGA 数据库
  • 13,090 个探针 
  • 涉及 126k 个 CpG 位点
  • 约 12k 个差异性甲基化区域 (DMR)
  • 12k 中有 9k (74%) 与 CpG 岛重叠

注:Twist 联盟泛癌种甲基化组合 - 1.5 MB 未获得 ISO-13485 认证

订购信息

104694

Twist 联盟泛癌种甲基化组合 - 1.5 MB,2 次反应

104695

Twist 联盟泛癌种甲基化组合 - 1.5 MB,12 次反应

104696

Twist 联盟泛癌种甲基化组合 - 1.5 MB,96 次反应
Twist 甲基化工作流程

101976

NEBNext® EM-seq™ 试剂盒,用于 Twist 靶向甲基化测序,96 个样本*

103557

Twist 甲基化增强剂,12 次反应

100578

Twist 通用阻断剂,12 次反应

100983

Twist 结合和纯化磁珠试剂盒,12 次反应

101174

Twist 快速杂交和洗脱试剂盒,12 次反应

103496

Twist 靶向甲基化测序工作流程,96 × 12 次反应

*还提供 2 次反应和 12 次反应规格用于富集

Twist 联盟临床研究外显子组 - 34.9 MB

Twist 联盟临床研究外显子组帮助支持博德研究所基因组学平台,并使用经验证的、来自临床患者样本的数据进行设计。该组合利用了 Twist 灵活的 NGS 平台,可轻松、快速地定制内容,进而对外显子组进行全面研究,并补充富集了与癌症以及罕见病和遗传性疾病相关的基因组临床相关区域。该检测具有 Twist NGS 探针出色的均一性,可降低每个样本的成本并提高通量效率,迄今为止,博德研究所已利用该检测处理了超过 250,000 个样本,保持了其在外显子组测序方面的领先地位。

该组合的全面设计包括 Twist 核心外显子组、线粒体基因组和其他经过验证的编码和非外显子目标区域(如 ACMG73 基因)、补充覆盖了 OMIM 和 COSMIC 数据库中的区域,以及博德研究定义的特异性靶标。

注:Twist 联盟临床研究外显子组 - 34.9 MB 内容已通过完整的 Twist 工作流程进行了充分验证。请联系 Twist 客户支持,获取关于检测设置的建议。

注:Twist 联盟临床研究外显子组 - 34.9 MB 未获得 ISO-13485 认证。

 

订购信息

104032

Twist 联盟临床研究外显子组,34.9 MB,2 次反应试剂盒

104033

Twist 联盟临床研究外显子组,34.9 MB,12 次反应试剂盒

104034

Twist 联盟临床研究外显子组,34.9 MB,96 次反应试剂盒

Twist 联盟 VCGS 外显子组 - 40.1 MB

在常规检测未能提供诊断的情况下,医生通常会转向利用 DNA 测序组合来寻求答案,尤其是当怀疑患者患有遗传性疾病时。但如果无专家指导,可能难以知道哪个组合才是最合适的。
Victorian Clinical Genetics Services (VCGS) 凭借数十年的临床基因组学经验,与 Twist 合作设计了一种诊断组合——Twist 联盟 VCGS 外显子组 - 40.1 MB,可覆盖整个外显子组,专门覆盖临床相关基因 (Mendeliome)。在设计该组合时,特别注意确保临床相关位点的额外覆盖度,这些位点位于外显子组传统靶向的基因编码区(即非编码区中的已知致病位点)之外。
Twist 联盟 VCGS 外显子组 - 40.1 MB 组合是一种出色、高度均一的组合,有助于简化遗传性疾病相关等位基因的识别,无论是通过载体筛选还是产前和产后检测。

注:Twist 联盟 VCGS 外显子组 - 40.1 MB 内容已通过完整的 Twist 工作流程进行了充分验证。请联系 Twist 客户支持,获取关于检测设置的建议。

注:Twist 联盟 VCGS 外显子组 - 40.1 MB 未获得 ISO-13485 认证。

探针总数

425.4K

包括 Twist 综合外显子组

394.1K 个探针

和 VCGS 设计的内容

31.3K 个探针

订购信息

104282

Twist 联盟 VCGS 外显子组 - 40.1 MB,2 次反应试剂盒

104283

Twist 联盟 VCGS 外显子组 - 40.1 MB,12 次反应试剂盒

104284

Twist 联盟 VCGS 外显子组 - 40.1 MB,96 次反应试剂盒

Twist 联盟犬外显子组 - 40.5 Mb

仅供研究使用,不得用于诊断

了解犬种之间的遗传变异对于了解性状的遗传调控及犬类疾病基础和病情发展至关重要。因此,外显子组等全面的基因组合是改善兽医诊断及相关临床医学的关键。这些类型的 NGS 组合还将加速研究进程,更深入地了解犬类癌症及潜在疗法。

我们与博德研究所的 Karlsson 试验室合作开发了 Twist 联盟犬外显子组,为犬类基因组学研究提供了合适的工具。此外,研究还发现人类和犬类肿瘤之间存在基因相似性,如 CNV、差异基因表达和结构染色体异常 1,因此犬类基因组研究对人类医学研究也有好处。

Twist 联盟犬外显子组组合的设计考虑了以下目标

  1. 包括犬类基因的编码外显子
  2. 实现犬类与人类基因组之间的比较基因组研究
  3. 包括人类癌症中已知的重要区域
  4. 实现经济高效的深度测序

这个组合包含超过 17k 个基于 CanFam3.1 的基因/靶标,另外还覆盖了与犬类癌症有关的基因/靶标。

基因

相关
COSMIC
突变

基因 相关
COSMIC
突变
基因 相关
COSMIC
突变
ABL1 19 HRAS 26 TET2 16
AKT1 6 MPL 0 FAS 3
ERBB2 19 SMAD4 31 STAT5B 4
GNAS 12 ATM 24 DNMT3A 6
MET 18 FBXW7 25 STAT3 6
RB1 18 IDH1 15 CREBBP 9
CCR4 3 NOTCH1 20 RHOA 1
MYC 5 SMARCB1 11 CHEK2 5
EGFR 123 BRAF 77 PRDM1 6
GNAQ 6 FGFR1 2 CDKN2A 108
KRAS 63 IDH2 12 FGFR3 17
PTPN11 28 NPM1 28 JAK3 6
CD28 3 SMO 5 PDGFRA 26
PLCG1 3 CDH1 7 STK11 22
ALK 8 FGFR2 8 CTNNB1 73
ERBB4 13 JAK2 5 GNA11 5
HNF1A 10 NRAS 35 KIT 139
MLH1 1 SRC 1 PTEN 146
RET 17 JAK1 12 VHL 124
APC 164 IL7R 4 CSF1R 8
EZH2 11 IL2RG 3 FLT3 30
TP53 1087 TNFAIP3 9 KDR 11
FYN 3 PIK3CA 97    


上表显示了 50 个这样的靶标,以及与各个基因相关的 COSMIC 突变 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5978258/) ——这些基因采用 2 倍平铺密度来获得更高的覆盖度。FOXA1 和 TERT 启动子采用 4 倍平铺密度。按照我们的标准做法,所有其他区域采用 1 倍平铺密度。

Twist 联盟犬外显子组包含由顶尖的犬类癌症研究人员精心策划的内容,并结合了 Twist 强劲的组合性能,为研究人员研究犬类疾病和人类罕见病提供了理想的工具。

1 Overgaard,N.H.,Fan,T.M.,Schachtschneider,K.M.,Principe,D.R.,Schook,L.B.,& Jungersen, G. (2018). Of Mice, Dogs, Pigs, and Men: Choosing the Appropriate Model for Immuno-Oncology Research. ILAR journal, 59(3), 247–262.

注:Twist 联盟犬外显子组 - 40.5 MB 未获得 ISO-13485 认证。

订购信息

105305

Twist 联盟犬外显子组 - 40.5 Mb,2 次反应试剂盒

105306

Twist 联盟犬外显子组 - 40.5 Mb,12 次反应试剂盒

105307

Twist 联盟犬外显子组 - 40.5 Mb,96 次反应试剂盒