甲基化图谱分析中的发现
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概述

Twist 人甲基化组检测组合通过 123 Mb 的基因组含量靶向 3.98M CpG 位点,以靶向生物学相关的甲基化标记。这一组合拥有广泛的内容,成为研究者从癌症转移、人体发育和功能基因组学等各种各样的应用中探索甲基化部分的不二之选。

该组合经过优化和验证,可与 Twist 新一代测序 (NGS) 甲基化检测系统配合使用,实现完整的端到端工作流程,性能行业领先。高效率捕获提高了表观基因组足迹的检测灵敏度,同时降低了测序成本。因此,该组合是筛选队列样本和发现甲基化区域差异的理想选择。

 

设计和工作流程效率
设计和工作流程效率
通过端到端工作流程优化性能
增加文库复杂性
加入加标内容物的灵活性
与普通微阵列相比,覆盖度更广泛
与普通微阵列相比,覆盖度更广泛
所有 CpG 位点的覆盖度增加约 4 倍
CpG 岛碱基覆盖度更高
基于更新的参考数据库
 与微阵列相比的优势
与微阵列相比的优势
甲基化区域差异的识别更精确
邻近 CpG 位点的上下游覆盖度更高
设计和工作流程效率

用于甲基化分析的完整解决方案可产生高度复杂且均一的测序片段。端到端方案结合创新的酶转化过程、优化的靶向富集工作流程和高度完善的组合设计过程,实现这一目标。
 

工作流程

Twist 人甲基化组检测组合通过 123 Mb 的基因组含量靶向 3.98M CpG 位点,以靶向生物学相关的甲基化标记。这一组合拥有广泛的内容,成为研究者从癌症转移、人体发育和功能基因组学等各种各样的应用中探索甲基化部分的不二之选。

该组合经过优化和验证,可与 Twist 新一代测序 (NGS) 甲基化检测系统配合使用,实现完整的端到端工作流程,性能行业领先。高效率捕获提高了表观基因组足迹的检测灵敏度,同时降低了测序成本。因此,该组合是筛选队列样本和发现甲基化区域差异的理想选择。

 

设计和工作流程效率
设计和工作流程效率
通过端到端工作流程优化性能
增加文库复杂性
加入加标内容物的灵活性
与普通微阵列相比,覆盖度更广泛
与普通微阵列相比,覆盖度更广泛
所有 CpG 位点的覆盖度增加约 4 倍
CpG 岛碱基覆盖度更高
基于更新的参考数据库
 与微阵列相比的优势
与微阵列相比的优势
甲基化区域差异的识别更精确
邻近 CpG 位点的上下游覆盖度更高
设计和工作流程效率

用于甲基化分析的完整解决方案可产生高度复杂且均一的测序片段。端到端方案结合创新的酶转化过程、优化的靶向富集工作流程和高度完善的组合设计过程,实现这一目标。
 

工作流程

数据
与普通微阵列相比,覆盖度更广泛

Twist 人甲基化组包含 3.98M CpG 位点,通过 123 Mb 的基因组含量靶向生物学相关的甲基化标记该组合高度靶向捕获并检测基因组中最新、注释和相关的 CpG 甲基化区域。基因组中 84% (17,915,988) 的 CpG 岛是通过用这一组合富集来鉴定的。并覆盖后续 CpG shore、shelve 和 open sea 中额外的 105,288,339 个碱基和碱基对。

与普通微阵列相比,覆盖度更广泛
与普通微阵列相比的优势

微阵列设计具有静态内容,可能会阻碍发现感兴趣的新表观遗传靶标。目前市场上的阵列也限制了表观基因组中的甲基化组覆盖度,很大比例的甲基化 CpG 位点未得到测量。Twist 人甲基化组靶向富集方法通过杂交捕获组合解决了上述限制问题,该组合能够在 NGS 平台提供的整个测序片段中扩展内容,提高单碱基分辨率。

微阵列在甲基化检测的极端处存在固有的局限性,这归因于低端处的背景噪声高、高端处的信号饱和。由于 NGS 动态范围更大,Twist 人甲基化组检测组合对甲基化区域 (DMR) 差异识别更准确,尤其是在甲基化部分的低端处和高端处(图 4)。

 

与普通微阵列相比的优势
性能

Twist 人甲基化组检测组合经过设计和湿实验室优化,可提供准确、灵敏且高性能的杂交捕获效率。该组合在 30 倍覆盖度下实现了 90% 碱基的覆盖度深度,中靶率为 95%,探针特异性高。另外,还实现了 1.54 的 80 倍富集,通过缩小碱基检出堆积的峰值和谷值之间的增量,保证整个靶向区域的高度均匀性。文库复杂性在 150 倍原始覆盖度的高测序深度下,以 < 4% 的重复率成反比表示。整体组合捕获效率指标显示,整个甲基化部分检测的水平置信度高,测序成本最低。

 

性能
与普通微阵列相比,覆盖度更广泛

Twist 人甲基化组包含 3.98M CpG 位点,通过 123 Mb 的基因组含量靶向生物学相关的甲基化标记该组合高度靶向捕获并检测基因组中最新、注释和相关的 CpG 甲基化区域。基因组中 84% (17,915,988) 的 CpG 岛是通过用这一组合富集来鉴定的。并覆盖后续 CpG shore、shelve 和 open sea 中额外的 105,288,339 个碱基和碱基对。

与普通微阵列相比,覆盖度更广泛
与普通微阵列相比的优势

微阵列设计具有静态内容,可能会阻碍发现感兴趣的新表观遗传靶标。目前市场上的阵列也限制了表观基因组中的甲基化组覆盖度,很大比例的甲基化 CpG 位点未得到测量。Twist 人甲基化组靶向富集方法通过杂交捕获组合解决了上述限制问题,该组合能够在 NGS 平台提供的整个测序片段中扩展内容,提高单碱基分辨率。

微阵列在甲基化检测的极端处存在固有的局限性,这归因于低端处的背景噪声高、高端处的信号饱和。由于 NGS 动态范围更大,Twist 人甲基化组检测组合对甲基化区域 (DMR) 差异识别更准确,尤其是在甲基化部分的低端处和高端处(图 4)。

 

与普通微阵列相比的优势
性能

Twist 人甲基化组检测组合经过设计和湿实验室优化,可提供准确、灵敏且高性能的杂交捕获效率。该组合在 30 倍覆盖度下实现了 90% 碱基的覆盖度深度,中靶率为 95%,探针特异性高。另外,还实现了 1.54 的 80 倍富集,通过缩小碱基检出堆积的峰值和谷值之间的增量,保证整个靶向区域的高度均匀性。文库复杂性在 150 倍原始覆盖度的高测序深度下,以 < 4% 的重复率成反比表示。整体组合捕获效率指标显示,整个甲基化部分检测的水平置信度高,测序成本最低。

 

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产品 SKU

105517

Twist 人甲基化组检测组合,2 次反应

105520

Twist 人甲基化组检测组合,12 次反应

105521

Twist 人甲基化组检测组合,96 次反应
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