一种封闭溶液适用于多种接头应用
一种封闭溶液适用于多种接头应用
一种封闭溶液适用于多种接头应用
概述 数据 订购和规格 资源
概述

优化新一代测序 (NGS) 的效率通常涉及在测序前对目标基因组区域进行靶向富集。在 Twist Bioscience 靶向富集工作流程中,设计了生物素化合成 DNA 探针与外显子或其他定制基因组区域杂交。与基因组 DNA 样本杂交后,对探针进行纯化,以产生针对靶向区域富集的样本。

Twist 通用封闭剂通过阻断接头序列之间的非特异性杂交,增强靶捕获的特异性。在杂交过程中阻断非特异性相互作用简化了实验设计和实施,降低了测序成本,并优化了靶向测序工作的结果。

封闭剂溶液
提高靶向捕获率
防止 TruSeq 兼容接头之间的交叉杂交
提高靶向富集工作流程的性能
无与伦比的灵活性
兼具灵活性
阻断许多不同的接头设计和条形码长度
兼容单重和多重靶向富集工作流程
提高靶向捕获率,不受组合大小的影响
最大程度提高效率
最大程度提高效率
即用型配方
降低每个样本的测序成本
简化实验设计和实施

优化新一代测序 (NGS) 的效率通常涉及在测序前对目标基因组区域进行靶向富集。在 Twist Bioscience 靶向富集工作流程中,设计了生物素化合成 DNA 探针与外显子或其他定制基因组区域杂交。与基因组 DNA 样本杂交后,对探针进行纯化,以产生针对靶向区域富集的样本。

Twist 通用封闭剂通过阻断接头序列之间的非特异性杂交,增强靶捕获的特异性。在杂交过程中阻断非特异性相互作用简化了实验设计和实施,降低了测序成本,并优化了靶向测序工作的结果。

封闭剂溶液
提高靶向捕获率
防止 TruSeq 兼容接头之间的交叉杂交
提高靶向富集工作流程的性能
无与伦比的灵活性
兼具灵活性
阻断许多不同的接头设计和条形码长度
兼容单重和多重靶向富集工作流程
提高靶向捕获率,不受组合大小的影响
最大程度提高效率
最大程度提高效率
即用型配方
降低每个样本的测序成本
简化实验设计和实施
数据

阻断脱靶结合,以提高靶向捕获率

Twist 通用封闭剂含有通用接头序列的专有混合物 1。这些序列结合基因组文库片段,阻断 TruSeq 兼容接头之间的交叉杂交,并提高靶向捕获率。Twist 通用封闭剂可以提高任何使用与 TruSeq 兼容接头的靶向富集工作流程的性能。

稳定的设计,最大程度提高灵活性

Twist 通用封闭剂的稳定设计可最大程度提高灵活性,从而提高靶向富集工作流程的效率。它们与所有的 Twist 靶向富集组合兼容,能够提高靶向读长的捕获,不受标签序列类型的影响,跨单重和多重靶向富集工作流程,并且无论组合大小如何。Twist 通用封闭剂可以让您灵活地选择最适合您实验的接头标签设计,并且靶向富集的性能不受影响。

NGS 通用封闭剂工作流程
稳定的设计,最大程度提高灵活性

Twist 通用封闭剂的稳定设计可最大程度提高灵活性,从而提高靶向富集工作流程的效率。它们与所有的 Twist 靶向富集组合兼容,能够提高靶向读长的捕获,不受标签序列类型的影响,跨单重和多重靶向富集工作流程,并且无论组合大小如何。Twist 通用封闭剂可以让您灵活地选择最适合您实验的接头标签设计,并且靶向富集的性能不受影响。

NGS 通用工作流程——目标碱基覆盖率图
TruSeq 接头标签设计中 Twist 通用封闭剂的性能

性能不受标签设计的影响。Twist 通用封闭剂在各种单端标签和双端标签 TruSeq 兼容接头上的靶向性能。从单个基因组来源产生单个文库(NA12878;Coriell)和 TruSeq 兼容的接头,其标签长度范围为 6 至 14 bp(不包括唯一分子标识符 [UMI] 长度)。在不存在或存在 Twist 通用封闭剂的情况下,按照生产商关于 16 小时杂交反应的建议,使用外显子组靶向富集组合 (33.1 Mb; Twist Bioscience) 进行杂交捕获,每个文库使用 500 ng gDNA。所有样本中均存在 Cot DNA。使用 NextSeq 500/550 High Output v2 试剂盒进行测序,生成 2x76 双端读长。将数据下采样至靶标大小的 150 倍,并使用 Picard Metrics 进行分析,映射质量为 20。中靶碱基百分比包括中靶和靶点附近的碱基,由公式 1 - PCT_OFF_BAIT 定义。误差线表示一个标准偏差或观测值范围;N ≥ 2。

 

中靶图 1 上的 NGS 试剂和试剂盒通用封闭剂百分比
稳定的封闭剂设计可最大程度提高组合设计的灵活性

性能不受组合大小的影响。Twist 通用封闭剂在各种组合大小中的靶向性能。单个文库由单个基因组来源 (NA12878; Coriell) 和 8 bp 双端标签 TruSeq 兼容接头生成。根据生产商的 16 小时杂交反应建议,在存在或不存在 Twist 通用封闭剂的情况下,使用各种大小的靶向富集组合(0.04 Mb 至 33.1 Mb;Twist Bioscience)和每个文库 500 ng 的 gDNA 进行杂交捕获。所有样本中均存在 Cot DNA。使用 NextSeq 500/550 High Output v2 试剂盒进行测序,生成 2x76 双端读长。将数据下采样至靶标大小的 150 倍,并使用 Picard Metrics 进行分析,映射质量为 20。中靶碱基百分比包括中靶和靶点附近的碱基,由公式 1 - PCT_OFF_BAIT 定义。误差线表示观测值范围;N=2。

中靶图 2 上的 NGS 试剂和试剂盒通用封闭剂百分比

阻断脱靶结合,以提高靶向捕获率

Twist 通用封闭剂含有通用接头序列的专有混合物 1。这些序列结合基因组文库片段,阻断 TruSeq 兼容接头之间的交叉杂交,并提高靶向捕获率。Twist 通用封闭剂可以提高任何使用与 TruSeq 兼容接头的靶向富集工作流程的性能。

稳定的设计,最大程度提高灵活性

Twist 通用封闭剂的稳定设计可最大程度提高灵活性,从而提高靶向富集工作流程的效率。它们与所有的 Twist 靶向富集组合兼容,能够提高靶向读长的捕获,不受标签序列类型的影响,跨单重和多重靶向富集工作流程,并且无论组合大小如何。Twist 通用封闭剂可以让您灵活地选择最适合您实验的接头标签设计,并且靶向富集的性能不受影响。

NGS 通用封闭剂工作流程
稳定的设计,最大程度提高灵活性

Twist 通用封闭剂的稳定设计可最大程度提高灵活性,从而提高靶向富集工作流程的效率。它们与所有的 Twist 靶向富集组合兼容,能够提高靶向读长的捕获,不受标签序列类型的影响,跨单重和多重靶向富集工作流程,并且无论组合大小如何。Twist 通用封闭剂可以让您灵活地选择最适合您实验的接头标签设计,并且靶向富集的性能不受影响。

NGS 通用工作流程——目标碱基覆盖率图
TruSeq 接头标签设计中 Twist 通用封闭剂的性能

性能不受标签设计的影响。Twist 通用封闭剂在各种单端标签和双端标签 TruSeq 兼容接头上的靶向性能。从单个基因组来源产生单个文库(NA12878;Coriell)和 TruSeq 兼容的接头,其标签长度范围为 6 至 14 bp(不包括唯一分子标识符 [UMI] 长度)。在不存在或存在 Twist 通用封闭剂的情况下,按照生产商关于 16 小时杂交反应的建议,使用外显子组靶向富集组合 (33.1 Mb; Twist Bioscience) 进行杂交捕获,每个文库使用 500 ng gDNA。所有样本中均存在 Cot DNA。使用 NextSeq 500/550 High Output v2 试剂盒进行测序,生成 2x76 双端读长。将数据下采样至靶标大小的 150 倍,并使用 Picard Metrics 进行分析,映射质量为 20。中靶碱基百分比包括中靶和靶点附近的碱基,由公式 1 - PCT_OFF_BAIT 定义。误差线表示一个标准偏差或观测值范围;N ≥ 2。

 

中靶图 1 上的 NGS 试剂和试剂盒通用封闭剂百分比
稳定的封闭剂设计可最大程度提高组合设计的灵活性

性能不受组合大小的影响。Twist 通用封闭剂在各种组合大小中的靶向性能。单个文库由单个基因组来源 (NA12878; Coriell) 和 8 bp 双端标签 TruSeq 兼容接头生成。根据生产商的 16 小时杂交反应建议,在存在或不存在 Twist 通用封闭剂的情况下,使用各种大小的靶向富集组合(0.04 Mb 至 33.1 Mb;Twist Bioscience)和每个文库 500 ng 的 gDNA 进行杂交捕获。所有样本中均存在 Cot DNA。使用 NextSeq 500/550 High Output v2 试剂盒进行测序,生成 2x76 双端读长。将数据下采样至靶标大小的 150 倍,并使用 Picard Metrics 进行分析,映射质量为 20。中靶碱基百分比包括中靶和靶点附近的碱基,由公式 1 - PCT_OFF_BAIT 定义。误差线表示观测值范围;N=2。

中靶图 2 上的 NGS 试剂和试剂盒通用封闭剂百分比
订购和规格
规格

工作流程步骤

靶向富集

储存温度

在 -5°C至 -30°C 下储存
产品 SKU

100856

Twist 通用封闭剂,2 次反应 

100578

Twist 通用封闭剂,12 次反应 

100767

Twist 通用封闭剂,96 次反应

Twist 通用封闭剂仅供研究使用,并遵守Twist 供应条款和条件中规定的额外使用限制。

规格

工作流程步骤

靶向富集

储存温度

在 -5°C至 -30°C 下储存
产品 SKU

100856

Twist 通用封闭剂,2 次反应 

100578

Twist 通用封闭剂,12 次反应 

100767

Twist 通用封闭剂,96 次反应

Twist 通用封闭剂仅供研究使用,并遵守Twist 供应条款和条件中规定的额外使用限制。

资源