在 8 小时内将唾液样本送入测序仪

以下博客由 Scott Rabuka 撰写，最初在DNA Genotek博客的 The Genetic Link（遗传链接）上发表。

Twist Bioscience 针对工作流程挑战的新解决方案

近年来，全球基因组学市场的增长已经不是什么秘密了。增长通常伴随着崭新的挑战和更高的期望。基因组学实验室可以证明这一点，很多人正在寻求创新的解决方案，以提高其处理样本的速度，同时保持其工作质量

在 DNA Genotek，我们开始与合成 DNA 的制造商 Twist Bioscience 携手合作，提供端到端的解决方案，以解决耗时且昂贵的新一代测序 (NGS) 的实验室工作流程。该博客特别突出强调了我们在通过靶向富集和整个外显子组测序改善 DNA 分离工作流程方面所做的不懈努力。

这项合作旨在实现在一天中的 8 小时内将样本送入测序仪的工作流程，更重要的是，在不降低质量或性能的前提下做到这一点。

在 DNA Genotek，我们的目标是 8 小时的工作流程，因此，技术人员可以在开始一天的工作时就有即用的唾液样本，并在结束一天的工作时可以将样本放在测序仪上。

找到瓶颈并解决问题

我们开始检测典型 DNA 样本的处理工作流程，并着眼于可以改善 DNA 分离过程的地方。我们的结论是样本制备、定量、和归一化给工作流程增加了可观的时间，我们需要减少这些步骤的持续时间，以对整个工作流程产生有意义的影响。

这将需要新试剂的开发创新。我们通过努力取得了这项工作的成功，并且推出了 prep•IT Q2A，从而可以快速、并通过液基去除 Oragene® 和 ORAcollect®唾液样本中的抑制剂。The protocols are adaptable for manual or automated processing with a preparation time of only 30 minutes.

While we addressed the upstream workflow, Twist focused their efforts on the downstream. Twist quickly recognized that its 16-hour hybridization was the longest step of the 2-day process and targeted it for improvement. Out of those development efforts, the new Twist Fast Hyb Kit was born. This new product was designed specifically to reduce the lengthy hybridization step to as little as 15 minutes.

该崭新的端到端解决方案的速度加快了多少？

综合我们在从唾液分离中的 DNA、Twist 快速杂交试剂盒、以及靶向富集技术方面的专业知识，我们得以在整个工作流程中节省了超过 24 小时的时间，从而交付一个简短的 8 小时的工作流程。

“具有快速、易于使用、强大、且可自动化的 prepIT®•Q2A 分离上游工作流程，将唾液 DNA 样本集成到 Twist Bioscience 快速富集系统中，并在下游进行靶向测序，可使样本在一天之内以可靠的质量进行测序。”—— Twist Bioscience 的产品经理 Bryan Hoglund。

另外一个成功的合作

在 DNA Genotek，我们非常高兴有机会与 Twist Bioscience 进行合作，我们期待学习如何帮助您在实验室中实施这种简化的工作流程。

prep•IT Q2A is now available. You can find more information on the prep•IT Q2A product page or email DNA Genotek at [email protected].

要了解有关 Twist Bioscience NGS 靶向富集解决方案的更多信息，请访问此处。

封面图像是从《Unsplash》 上的 @unitednations 修改而来的