无需退而求其次
无需退而求其次
无需退而求其次
概述 病毒检测 数据分析 订购和规格 资源
概述

世界各地的病毒研究团队和治疗领域都在快速应对冠状病毒疫情。这些研究团队需要稳定、可靠的基因组学工具对病毒样本进行分类和表征。Twist 提供仅供研究使用 (RUO) 的 NGS 靶向富集组合,可用于 SARS-CoV-2 病毒的检测和表征。该组合靶向大约 30 kb 的病毒基因组,有大约 1,000 个针对 SARS-CoV-2 基因组(GenBank:MN908947.3)的探针。

检测
检测灵敏度高
可以检测低至 10 个拷贝的病毒样本,富集倍数 > 100,000
测序
序列信息更完整
富集 1 倍或以上后,覆盖 >99.9% 的基因组
能鉴定病毒突变
监测
可用于环境监测和监控
评估病毒随时间的进化
追踪病毒株的来源和传播模式
检测不足时

引入 SARS-CoV-2 NGS 检测 - RUO 分析:一种仅用于研究的灵敏度很高的核酸杂交捕获分析法,用于 SARS-CoV-2 病毒的检测、表征和环境监测。这种分析方法运用了 Twist Bioscience 通过 DNA 合成快速开发病毒特异性组合检测的独特能力以及 Biotia 的综合数据分析软件和报告功能(COVID-DX (1.0 版) )。

  • 每个样本中的敏感检测水平低至每毫升 800 个病毒拷贝 
  • 富集 1 倍或以上后,覆盖 >99.9% 的基因组 
  • 能鉴定新型病毒突变 
  • RUO 软件分析报告提供用于流行病学监控的变异分型和系统发生分析 
     

包含 Biotia 分析软件的 Twist

 

世界各地的病毒研究团队和治疗领域都在快速应对冠状病毒疫情。这些研究团队需要稳定、可靠的基因组学工具对病毒样本进行分类和表征。Twist 提供仅供研究使用 (RUO) 的 NGS 靶向富集组合,可用于 SARS-CoV-2 病毒的检测和表征。该组合靶向大约 30 kb 的病毒基因组,有大约 1,000 个针对 SARS-CoV-2 基因组(GenBank:MN908947.3)的探针。

检测
检测灵敏度高
可以检测低至 10 个拷贝的病毒样本,富集倍数 > 100,000
测序
序列信息更完整
富集 1 倍或以上后,覆盖 >99.9% 的基因组
能鉴定病毒突变
监测
可用于环境监测和监控
评估病毒随时间的进化
追踪病毒株的来源和传播模式
检测不足时

引入 SARS-CoV-2 NGS 检测 - RUO 分析:一种仅用于研究的灵敏度很高的核酸杂交捕获分析法,用于 SARS-CoV-2 病毒的检测、表征和环境监测。这种分析方法运用了 Twist Bioscience 通过 DNA 合成快速开发病毒特异性组合检测的独特能力以及 Biotia 的综合数据分析软件和报告功能(COVID-DX (1.0 版) )。

  • 每个样本中的敏感检测水平低至每毫升 800 个病毒拷贝 
  • 富集 1 倍或以上后,覆盖 >99.9% 的基因组 
  • 能鉴定新型病毒突变 
  • RUO 软件分析报告提供用于流行病学监控的变异分型和系统发生分析 
     

包含 Biotia 分析软件的 Twist

 

病毒检测

用于病毒检测的新一代测序

新一代测序 (NGS) 可对各种样本类型(包括血液、鼻拭子和粪便等)中的感染进行高通量、特异性鉴定。然而在病毒感染中,由于目标病毒浓度极低,并存在高宿主背景,直接测序非常困难。靶向捕获通过使用基于 DNA 的杂交探针从混合基因组样本中分离特定序列,能够提高 NGS 方案的灵敏度和特异性。

通过高效设计实现高灵敏度

Twist 高度敏感和准确的靶向捕获能够有效检测病毒 RNA。我们证明了靶向富集能够捕获和检测掺入人参考 RNA 的各种病毒拷贝数的病毒基因组。在病毒载量较高(大约 100 万个拷贝)的情况下,即使只有 25,000 次读取*,也能恢复完整的基因组。而在拷贝数较低的情况下,病毒模板大部分的覆盖度得以维持。即使使用 800 万个映射读长,也没有从阴性质控品图谱到病毒模板的读长,证明我们在 10 个拷贝上的检测代表了真正的捕获,而非背景污染。 更多详细信息,请参见应用说明。

*在使用 COVID-Dx 时,需要进行 100 万次读取才能进行分析。

NGS SARS-CoV-2 研究组合基因组覆盖度
从纯化的 RNA 到测序的简单工作流

Twist SARS-CoV-2 研究组合提供了一个简单易用的实验方案,使用易于获取的组件即可完成从纯化的 RNA 样本到测序的过程。

NGS SARS-CoV-2 研究组合工作流

用于病毒检测的新一代测序

新一代测序 (NGS) 可对各种样本类型(包括血液、鼻拭子和粪便等)中的感染进行高通量、特异性鉴定。然而在病毒感染中,由于目标病毒浓度极低,并存在高宿主背景,直接测序非常困难。靶向捕获通过使用基于 DNA 的杂交探针从混合基因组样本中分离特定序列,能够提高 NGS 方案的灵敏度和特异性。

通过高效设计实现高灵敏度

Twist 高度敏感和准确的靶向捕获能够有效检测病毒 RNA。我们证明了靶向富集能够捕获和检测掺入人参考 RNA 的各种病毒拷贝数的病毒基因组。在病毒载量较高(大约 100 万个拷贝)的情况下,即使只有 25,000 次读取*,也能恢复完整的基因组。而在拷贝数较低的情况下,病毒模板大部分的覆盖度得以维持。即使使用 800 万个映射读长,也没有从阴性质控品图谱到病毒模板的读长,证明我们在 10 个拷贝上的检测代表了真正的捕获,而非背景污染。 更多详细信息,请参见应用说明。

*在使用 COVID-Dx 时,需要进行 100 万次读取才能进行分析。

NGS SARS-CoV-2 研究组合基因组覆盖度
从纯化的 RNA 到测序的简单工作流

Twist SARS-CoV-2 研究组合提供了一个简单易用的实验方案,使用易于获取的组件即可完成从纯化的 RNA 样本到测序的过程。

NGS SARS-CoV-2 研究组合工作流
数据分析

Biotia 分析

Twist SARS-CoV-2 研究组合结合了额外的试剂和分析,能够创建一种从样本收集到三级分析的端对端解决方案,从而能够进行 SARS-CoV-2 NGS 检测。

Biotia COVID-DX(1.0 版)软件可提供包含 SARS-CoV-2 病毒全序列的研究型报告,从而能够深入了解病毒在传播中发生的突变、基因变异和进化。FASTQ 文件(测序输出结果)可在实验室生成并提交至 Biotia COVID-DX(1.0 版),这款云端软件可用于生成仅限研究使用的报告。购买的每个 SARS-CoV-2 NGS 检测试剂盒中包含了每个样本的 COVID-DX(1.0 版)生物信息学分析积分。

要获得 Biotia 分析积分,只需通过 Biotia 用户门户网站 www.biotia.io 进行注册,并输入您下达订单后通过电子邮件发送给您的唯一订单编号即可。这些积分可通过软件的报告生成组件来提供运行样本的访问权限。

已鉴别的遗传变异

通过将检测病毒株与 SARS-CoV-2 参考基因组 (NC_045512.2) 进行比对,以及基因位置/位点、改变和文献注释(如有)的信息来确定遗传变异。

 

检测到的 SARS-CoV-2 基因 位点 (bp) 改变 参考值
GORF1ab 241 T 未检出
ORF1ab 478 T 未检出
ORF1ab 3,037 T 未检出
ORF1ab 14408* T 未检出
ORF1ab 18877 T 未检出
S 23403 G 未检出
3a 25563 T 未检出
3’UTR 29759 C 未检出

 

序列结果映射至整个基因组。

显示了从您的检测样本中回收的 SARS-CoV-2 基因组的百分比,以及与参考基因组相比鉴别出的基因突变体。显示了来自世界各地的 SARS-CoV-2 病毒株的已知遗传变异体比例(底部)。

序列结果映射至整个基因组。
系统发生分析和监测监督。

检测样本与分支 20A 关系最密切

在美国、比利时和法国的测序样本中,该分支的频率最高

系统发生分析和监测监督。

Biotia 分析

Twist SARS-CoV-2 研究组合结合了额外的试剂和分析,能够创建一种从样本收集到三级分析的端对端解决方案,从而能够进行 SARS-CoV-2 NGS 检测。

Biotia COVID-DX(1.0 版)软件可提供包含 SARS-CoV-2 病毒全序列的研究型报告,从而能够深入了解病毒在传播中发生的突变、基因变异和进化。FASTQ 文件(测序输出结果)可在实验室生成并提交至 Biotia COVID-DX(1.0 版),这款云端软件可用于生成仅限研究使用的报告。购买的每个 SARS-CoV-2 NGS 检测试剂盒中包含了每个样本的 COVID-DX(1.0 版)生物信息学分析积分。

要获得 Biotia 分析积分,只需通过 Biotia 用户门户网站 www.biotia.io 进行注册,并输入您下达订单后通过电子邮件发送给您的唯一订单编号即可。这些积分可通过软件的报告生成组件来提供运行样本的访问权限。

已鉴别的遗传变异

通过将检测病毒株与 SARS-CoV-2 参考基因组 (NC_045512.2) 进行比对,以及基因位置/位点、改变和文献注释(如有)的信息来确定遗传变异。

 

检测到的 SARS-CoV-2 基因 位点 (bp) 改变 参考值
GORF1ab 241 T 未检出
ORF1ab 478 T 未检出
ORF1ab 3,037 T 未检出
ORF1ab 14408* T 未检出
ORF1ab 18877 T 未检出
S 23403 G 未检出
3a 25563 T 未检出
3’UTR 29759 C 未检出

 

序列结果映射至整个基因组。

显示了从您的检测样本中回收的 SARS-CoV-2 基因组的百分比,以及与参考基因组相比鉴别出的基因突变体。显示了来自世界各地的 SARS-CoV-2 病毒株的已知遗传变异体比例(底部)。

序列结果映射至整个基因组。
系统发生分析和监测监督。

检测样本与分支 20A 关系最密切

在美国、比利时和法国的测序样本中,该分支的频率最高

系统发生分析和监测监督。
订购和规格
产品 SKU + 文库制备 + 试剂 + 研究组合 + BIOTIA

104796

Twist SARS-CoV-2 NGS 检测- RUO,16 个样本

104797

Twist SARS-CoV-2 NGS 检测- RUO,96 个样本

104799

Twist SARS-CoV-2 NGS 检测- RUO,768 个样本
产品 SKU - 研究组合 + BIOTIA

103564

Twist SARS-CoV-2 研究组合 + Biotia COVID DX (v1.0) - RUO,2 次反应,试剂盒

103566

Twist SARS-CoV-2 研究组合 + Biotia COVID DX (v1.0) - RUO,12 次反应,试剂盒

103567

Twist SARS-CoV-2 研究组合 + Biotia COVID DX (v1.0) - RUO,96 次反应,试剂盒
产品 SKU - 研究组合

102016

Twist SARS-CoV-2 研究组合,2 次反应,试剂盒

102017

Twist SARS-CoV-2 研究组合,12 次反应,试剂盒

102018

Twist SARS-CoV-2 研究组合,96 次反应,试剂盒

Twist 合成 SARS-CoV-2 RNA 质控品仅供研究使用,并遵守 Twist 供应条款和条件中规定的额外使用限制。

产品 SKU + 文库制备 + 试剂 + 研究组合 + BIOTIA

104796

Twist SARS-CoV-2 NGS 检测- RUO,16 个样本

104797

Twist SARS-CoV-2 NGS 检测- RUO,96 个样本

104799

Twist SARS-CoV-2 NGS 检测- RUO,768 个样本
产品 SKU - 研究组合 + BIOTIA

103564

Twist SARS-CoV-2 研究组合 + Biotia COVID DX (v1.0) - RUO,2 次反应,试剂盒

103566

Twist SARS-CoV-2 研究组合 + Biotia COVID DX (v1.0) - RUO,12 次反应,试剂盒

103567

Twist SARS-CoV-2 研究组合 + Biotia COVID DX (v1.0) - RUO,96 次反应,试剂盒
产品 SKU - 研究组合

102016

Twist SARS-CoV-2 研究组合,2 次反应,试剂盒

102017

Twist SARS-CoV-2 研究组合,12 次反应,试剂盒

102018

Twist SARS-CoV-2 研究组合,96 次反应,试剂盒

Twist 合成 SARS-CoV-2 RNA 质控品仅供研究使用,并遵守 Twist 供应条款和条件中规定的额外使用限制。

资源