发现新型病毒
发现新型病毒
发现新型病毒
概述 数据 数据分析 订购和规格 资源
概述

发现新的病毒种类

SARS-CoV-2 大流行的出现凸显了对更好地检测和监测新型病毒病原体工具的需要。

Twist 全面病毒研究组合提供完整的靶向富集解决方案,该解决方案使研究人员能够快速识别和表征各种样本类型中新型且高度演变的病毒。

检测
全面检测新型病毒种类
超过 1M 独特探针靶向 3,153 个病毒基因组
捕获 ssDNA、dsDNA、dsRNA 和 ssRNA 病毒
病毒的发现
新型变异探索
详尽的组合设计涵盖人类和非人类病毒病原体
长探针为发现新变异提供较高的错配容许率
筛选
端到端病毒筛查解决方案
使用 One Codex 简单分析
快速生成数据报告和可随时出版的数据
检测新的和经过演变的病毒种类

Twist 全面病毒研究组合涵盖了 3,153 种病毒的参考序列,包括 15,488 株不同菌株。可检测到的病毒示例包括:

腺病毒

冠状病毒

疱疹病毒

甲型流感和乙型流感

诺如病毒

乳头瘤病毒

细小病毒

小核糖核酸病毒

痘病毒

逆转录病毒

弹状病毒
 

点击此处查看所有系列

发现新的病毒种类

SARS-CoV-2 大流行的出现凸显了对更好地检测和监测新型病毒病原体工具的需要。

Twist 全面病毒研究组合提供完整的靶向富集解决方案,该解决方案使研究人员能够快速识别和表征各种样本类型中新型且高度演变的病毒。

检测
全面检测新型病毒种类
超过 1M 独特探针靶向 3,153 个病毒基因组
捕获 ssDNA、dsDNA、dsRNA 和 ssRNA 病毒
病毒的发现
新型变异探索
详尽的组合设计涵盖人类和非人类病毒病原体
长探针为发现新变异提供较高的错配容许率
筛选
端到端病毒筛查解决方案
使用 One Codex 简单分析
快速生成数据报告和可随时出版的数据
检测新的和经过演变的病毒种类

Twist 全面病毒研究组合涵盖了 3,153 种病毒的参考序列,包括 15,488 株不同菌株。可检测到的病毒示例包括:

腺病毒

冠状病毒

疱疹病毒

甲型流感和乙型流感

诺如病毒

乳头瘤病毒

细小病毒

小核糖核酸病毒

痘病毒

逆转录病毒

弹状病毒
 

点击此处查看所有系列

数据
全面的新型病毒检测

我们从 RefSeq、FluDB 和 VIPR 数据库中抽取了参考序列,以设计构成 Twist 全面病毒研究组合的 1,052,421 个独特探针。

该组合广泛涵盖每个病毒家族,其中至少包含一种已知会感染人类的病毒,包括腺病毒、冠状病毒、黄病毒、诺如病毒、流感病毒等。

除了针对人类感染性病毒外,该组合还涵盖动物病毒(例如蝙蝠冠状病毒)。这有助于发现新型病毒物种,无论来源如何。

其绝对的广度允许 Twist 全面病毒研究组合检测新型和演变的病毒菌株,包括与 2020 年 6 月在养猪工人中爆发的 H1N1 流感相关的菌株。

全面的新型病毒检测
检测高度变异的病毒序列

动物中的冠状病毒纤突和流感血凝素 (HA) 糖蛋白的自然选择促进了 SARS-CoV-2 和 H1N1 流感从动物向人类传播。

在这里,我们证明了可以通过 Twist 全面病毒研究组合成功地检测这些难以捕获的序列,包括近期发现的冠状病毒(新加坡的 RoBat-CoV GCCDC1)的纤突区域和从 2020 年 6 月在养猪工人中爆发的 H1N1 流感中分离出的 HA 段。

我们的研究组合使每个序列 > 99.8% 覆盖率达到至少 1 倍的深度。
 

检测高度变异的病毒序列
新型病毒的富集

我们通过生成一系列 HA 区段来确定 Twist 全面病毒研究组合的错配灵敏度,以包含从野生型 HA 区段的 5% 到 30% 变异范围内定义的序列变异水平。

在最高 10% 序列变异性的样本中,达到 1 倍覆盖率的总捕获。总之,这些数据表明,Twist 全面病毒研究组合可以捕获高度演变的病毒序列。

新型病毒的富集
多重检测多种病毒

通过 Twist 全面病毒研究组合,可以对病毒进行多重检测,从而实现将宏基因组学应用于各种样本类型。

在一项联合感染检测中,该组合成功捕获了四种不同病毒类型(星状病毒 —— ssRNA、BK 病毒 —— dsDNA、博卡病毒 —— ssDNA 和小双节 RNA 病毒 —— dsRNA),这些病毒插入人类 RNA,片段长度仅有 1.2 M。
 

多重检测多种病毒
全面的新型病毒检测

我们从 RefSeq、FluDB 和 VIPR 数据库中抽取了参考序列,以设计构成 Twist 全面病毒研究组合的 1,052,421 个独特探针。

该组合广泛涵盖每个病毒家族,其中至少包含一种已知会感染人类的病毒,包括腺病毒、冠状病毒、黄病毒、诺如病毒、流感病毒等。

除了针对人类感染性病毒外,该组合还涵盖动物病毒(例如蝙蝠冠状病毒)。这有助于发现新型病毒物种,无论来源如何。

其绝对的广度允许 Twist 全面病毒研究组合检测新型和演变的病毒菌株,包括与 2020 年 6 月在养猪工人中爆发的 H1N1 流感相关的菌株。

全面的新型病毒检测
检测高度变异的病毒序列

动物中的冠状病毒纤突和流感血凝素 (HA) 糖蛋白的自然选择促进了 SARS-CoV-2 和 H1N1 流感从动物向人类传播。

在这里,我们证明了可以通过 Twist 全面病毒研究组合成功地检测这些难以捕获的序列,包括近期发现的冠状病毒(新加坡的 RoBat-CoV GCCDC1)的纤突区域和从 2020 年 6 月在养猪工人中爆发的 H1N1 流感中分离出的 HA 段。

我们的研究组合使每个序列 > 99.8% 覆盖率达到至少 1 倍的深度。
 

检测高度变异的病毒序列
新型病毒的富集

我们通过生成一系列 HA 区段来确定 Twist 全面病毒研究组合的错配灵敏度,以包含从野生型 HA 区段的 5% 到 30% 变异范围内定义的序列变异水平。

在最高 10% 序列变异性的样本中,达到 1 倍覆盖率的总捕获。总之,这些数据表明,Twist 全面病毒研究组合可以捕获高度演变的病毒序列。

新型病毒的富集
多重检测多种病毒

通过 Twist 全面病毒研究组合,可以对病毒进行多重检测,从而实现将宏基因组学应用于各种样本类型。

在一项联合感染检测中,该组合成功捕获了四种不同病毒类型(星状病毒 —— ssRNA、BK 病毒 —— dsDNA、博卡病毒 —— ssDNA 和小双节 RNA 病毒 —— dsRNA),这些病毒插入人类 RNA,片段长度仅有 1.2 M。
 

多重检测多种病毒
数据分析
One Codex 分析

Twist 全面病毒研究组合包括对网络分析工具 One Codex 的访问。除了提供分析支持外,该基于云的工具还允许用户通过使用可打印的报告和可即时发布的数据来记录其最新的病毒发现工作。

One Codex 简化了使用 Twist 全面病毒研究组合所获得的序列数据的分析。在以简单的拖放界面上传序列数据后,用户可以在几分钟内生成一份报告,该报告详细说明了其新的病毒发现结果。用户还可以使用其检测阈值和解读来自定义生物信息学工作流程。

购买 Twist 全面病毒研究组合附带了初次使用 One Codex 分析结果所需的一切,包括优惠券代码和详细说明。在 onecodex.com 上了解有关此简化的微生物分析平台的更多信息
 

One Codex 分析
One Codex 分析

Twist 全面病毒研究组合包括对网络分析工具 One Codex 的访问。除了提供分析支持外,该基于云的工具还允许用户通过使用可打印的报告和可即时发布的数据来记录其最新的病毒发现工作。

One Codex 简化了使用 Twist 全面病毒研究组合所获得的序列数据的分析。在以简单的拖放界面上传序列数据后,用户可以在几分钟内生成一份报告,该报告详细说明了其新的病毒发现结果。用户还可以使用其检测阈值和解读来自定义生物信息学工作流程。

购买 Twist 全面病毒研究组合附带了初次使用 One Codex 分析结果所需的一切,包括优惠券代码和详细说明。在 onecodex.com 上了解有关此简化的微生物分析平台的更多信息
 

One Codex 分析
订购和规格
产品 SKU

103545

Twist 全面病毒研究组合及 One Codex 软件,2次反应,试剂盒

103547

Twist 全面病毒研究组合及 One Codex 软件,12次反应,试剂盒

103458

Twist 全面病毒研究组合及 One Codex 软件,96次反应,试剂盒
规格

工作流程步骤

靶向富集

格式

dsDNA

组合大小

36.8 Mb

内容

病毒序列

设计数据库

FluDB, RefSeq, VIPRdb

储存

在 -5 至 -30C 间储存
产品 SKU

103545

Twist 全面病毒研究组合及 One Codex 软件,2次反应,试剂盒

103547

Twist 全面病毒研究组合及 One Codex 软件,12次反应,试剂盒

103458

Twist 全面病毒研究组合及 One Codex 软件,96次反应,试剂盒
规格

工作流程步骤

靶向富集

格式

dsDNA

组合大小

36.8 Mb

内容

病毒序列

设计数据库

FluDB, RefSeq, VIPRdb

储存

在 -5 至 -30C 间储存
资源