性能无与伦比,不惧任何规模
性能无与伦比,不惧任何规模
性能无与伦比,不惧任何规模
概述 寡核苷酸池 新的克隆寡核苷酸池 应用 资源
概述

性能无与伦比,不惧任何规模

我们革命性的硅基 DNA 合成平台能够在单次运行中生成超过一百万个独特的 ssDNA 寡核苷酸。每个芯片包含数千个离散簇,每个簇包含 121 个可单独定位的表面,这些表面能够合成一个独特的寡核苷酸序列。硅芯片技术如下图所示。

由于芯片的 DNA 合成规模庞大,可以组装成池的独特寡核苷酸数量几乎没有限制。不要束缚于应用结果,订购为您的实验量身定制的寡核苷酸池。

性能无与伦比,不惧任何规模

 

更多创新的空间
 

不为长度所束缚。对您所需的元件和序列进行编码,包括启动子、增强子、向导和探针在内统统囊括于扩展架构中。利用长达 300 nt 的寡核苷酸,可在单个设计中编码多种元件,方便您利用每个寡核苷酸实现更多需求。

 

更多创新的空间

 


一次筛选,百分百正确
 

无与伦比的寡核苷酸池均一度,无任何偏倚,每次筛选可提供更多特异性靶标。这意味着花费较少的精力就可达到您所需的数据覆盖度,节省时间和成本。

筛选一次,百分百正确

 


数据准,信心足
 

Twist 寡核苷酸池精准、均一,您可以充分信赖实验结果的质量。避免因为合成错误或效率低下而错过数据点。对于长度不超过 300nt 的寡核苷酸,以及任何大小的池,都能实现行业领先的寡核苷酸占比和低错误率。您可根据应用所需的精准度和长度,来使用这些高品质的寡核苷酸池。

 

数据准,信心足

有疑问吗?

告诉我们您想详细了解哪些方面的信息。我们可以为您提供帮助!

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我们革命性的硅基 DNA 合成平台能够在单次运行中生成超过一百万个独特的 ssDNA 寡核苷酸。每个芯片包含数千个离散簇,每个簇包含 121 个可单独定位的表面,这些表面能够合成一个独特的寡核苷酸序列。硅芯片技术如下图所示。

由于芯片的 DNA 合成规模庞大,可以组装成池的独特寡核苷酸数量几乎没有限制。不要束缚于应用结果,订购为您的实验量身定制的寡核苷酸池。

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不为长度所束缚。对您所需的元件和序列进行编码,包括启动子、增强子、向导和探针在内统统囊括于扩展架构中。利用长达 300 nt 的寡核苷酸,可在单个设计中编码多种元件,方便您利用每个寡核苷酸实现更多需求。

 

更多创新的空间

 


一次筛选,百分百正确
 

无与伦比的寡核苷酸池均一度,无任何偏倚,每次筛选可提供更多特异性靶标。这意味着花费较少的精力就可达到您所需的数据覆盖度,节省时间和成本。

筛选一次,百分百正确

 


数据准,信心足
 

Twist 寡核苷酸池精准、均一,您可以充分信赖实验结果的质量。避免因为合成错误或效率低下而错过数据点。对于长度不超过 300nt 的寡核苷酸,以及任何大小的池,都能实现行业领先的寡核苷酸占比和低错误率。您可根据应用所需的精准度和长度,来使用这些高品质的寡核苷酸池。

 

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寡核苷酸池

寡核苷酸池
 

Twist 寡核苷酸池是利用我们的硅基 DNA 编写技术合成的高度多样化的单链寡核苷酸集合。我们的合成平台能够在每次运行中大规模并行生产成千上万个高质量、高精度的寡核苷酸,从而生成复杂多样的寡核苷酸池,用于 CRISPR 筛选等应用。

工作原理 
 

您向我们提供寡核苷酸序列,我们将合成您自主设计的寡核苷酸池文库,如此您能够将时间花费在实验和发现上。

文库

高度均一的寡核苷酸合成
 

来自典型寡核苷酸池(含 23,000 条 90 mer 寡核苷酸)的 NGS 质量控制数据展示了 300x 测序覆盖度下寡核苷酸池的均一性。对应表格表示该寡核苷酸池的均一性指标。Twist 寡核苷酸合成无偏倚,不仅具有高度均一性,而且能实现完全的寡核苷酸占比。

寡核苷酸读取计数

寡核苷酸池测序分析
 

对 Twist Bioscience 生产的寡核苷酸池和一种基于芯片的竞争产品进行测序分析,结果表明 Twist 寡核苷酸池包含 100% 的预期序列,而且正确序列百分比高于竞争产品。

分析


规格
 

寡核苷酸长度 高达 300 nt
寡核苷酸池大小 池的大小无限制
产量 每个寡核苷酸 > 0.2 fmol
均一性 90% 以上的寡核苷酸在平均信号频数的 2.0 倍内出现
错误率 最多 1:3000
周转时间 5 个工作日起
价格 比同行优惠的定价

 

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寡核苷酸池
 

Twist 寡核苷酸池是利用我们的硅基 DNA 编写技术合成的高度多样化的单链寡核苷酸集合。我们的合成平台能够在每次运行中大规模并行生产成千上万个高质量、高精度的寡核苷酸,从而生成复杂多样的寡核苷酸池,用于 CRISPR 筛选等应用。

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文库

高度均一的寡核苷酸合成
 

来自典型寡核苷酸池(含 23,000 条 90 mer 寡核苷酸)的 NGS 质量控制数据展示了 300x 测序覆盖度下寡核苷酸池的均一性。对应表格表示该寡核苷酸池的均一性指标。Twist 寡核苷酸合成无偏倚,不仅具有高度均一性,而且能实现完全的寡核苷酸占比。

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对 Twist Bioscience 生产的寡核苷酸池和一种基于芯片的竞争产品进行测序分析,结果表明 Twist 寡核苷酸池包含 100% 的预期序列,而且正确序列百分比高于竞争产品。

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规格
 

寡核苷酸长度 高达 300 nt
寡核苷酸池大小 池的大小无限制
产量 每个寡核苷酸 > 0.2 fmol
均一性 90% 以上的寡核苷酸在平均信号频数的 2.0 倍内出现
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新的克隆寡核苷酸池

新的克隆寡核苷酸池

寡核苷酸池的质量是实验成功的基础。合成或克隆过程中的错误很容易使寡核苷酸池的质量出现偏差,导致所需序列的表达过度和表达不足。Twist 现在提供优化的克隆过程,这使您可以进一步避免测试 PCR 扩增条件、选择正确的聚合酶和引物对以及设计克隆工作流程所带来的困难。避开繁琐的流程,让 Twist Bioscience 为您合成和克隆寡核苷酸池。

 

工作原理 

您向我们提供寡核苷酸序列,我们将合成和克隆您自主设计的寡核苷酸池文库,如此您能够将时间花费在实验和发现上。

克隆

 

 

线性和克隆寡核苷酸池的均一性

 

均一性

一个由 15,154 个寡核苷酸组成的寡核苷酸池被合成并扩增,用于评估池的均一性,以及在靶寡核苷酸的百分比和丢失百分比。然后使用 Twist 内部克隆方案将扩增的池克隆到定制载体中。克隆前和克隆后池的 NGS 数据的比较表明,在靶寡核苷酸的百分比仍然 > 96%,并无丢失,且两者第 90/10 个百分位数比率之间的差异为 0.1。
 

高质量的克隆寡核苷酸池 

 

克隆

图 1 A 和图 1 B 总结了从由 15154 个寡核苷酸组成的线性和克隆寡核苷酸池中收集的数据。这些图显示了每个寡核苷酸的 GC 含量(x 轴)和该特定寡核苷酸的均一化计数(y 轴)。这说明以 GC 含量为基础的寡核苷酸的偏差有限,并且寡核苷酸池的计数均匀分布,丢失有限。第 95/5 个百分位数表示 90% 的寡核苷酸在平均信号频数的 x 倍范围内。对于线性寡核苷酸池(图 1A),90% 在平均信号频数的 2 倍以内。克隆后(图 1B),90% 保持在平均信号频数的 2 倍以内,表明寡核苷酸池的质量和均一性在整个 Twist 克隆过程中保持不变。


规格 

 

寡核苷酸长度 高达 100 nt
产量 从 50 ug 开始
均一性 均一的合成确保了出色的寡核苷酸
表达,靶标寡核苷酸的表达率 > 95%
周转时间 新的载体需 6-8 周,已克隆寡核苷酸池的载体需 4-6 周
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新的克隆寡核苷酸池

寡核苷酸池的质量是实验成功的基础。合成或克隆过程中的错误很容易使寡核苷酸池的质量出现偏差,导致所需序列的表达过度和表达不足。Twist 现在提供优化的克隆过程,这使您可以进一步避免测试 PCR 扩增条件、选择正确的聚合酶和引物对以及设计克隆工作流程所带来的困难。避开繁琐的流程,让 Twist Bioscience 为您合成和克隆寡核苷酸池。

 

工作原理 

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克隆

 

 

线性和克隆寡核苷酸池的均一性

 

均一性

一个由 15,154 个寡核苷酸组成的寡核苷酸池被合成并扩增,用于评估池的均一性,以及在靶寡核苷酸的百分比和丢失百分比。然后使用 Twist 内部克隆方案将扩增的池克隆到定制载体中。克隆前和克隆后池的 NGS 数据的比较表明,在靶寡核苷酸的百分比仍然 > 96%,并无丢失,且两者第 90/10 个百分位数比率之间的差异为 0.1。
 

高质量的克隆寡核苷酸池 

 

克隆

图 1 A 和图 1 B 总结了从由 15154 个寡核苷酸组成的线性和克隆寡核苷酸池中收集的数据。这些图显示了每个寡核苷酸的 GC 含量(x 轴)和该特定寡核苷酸的均一化计数(y 轴)。这说明以 GC 含量为基础的寡核苷酸的偏差有限,并且寡核苷酸池的计数均匀分布,丢失有限。第 95/5 个百分位数表示 90% 的寡核苷酸在平均信号频数的 x 倍范围内。对于线性寡核苷酸池(图 1A),90% 在平均信号频数的 2 倍以内。克隆后(图 1B),90% 保持在平均信号频数的 2 倍以内,表明寡核苷酸池的质量和均一性在整个 Twist 克隆过程中保持不变。


规格 

 

寡核苷酸长度 高达 100 nt
产量 从 50 ug 开始
均一性 均一的合成确保了出色的寡核苷酸
表达,靶标寡核苷酸的表达率 > 95%
周转时间 新的载体需 6-8 周,已克隆寡核苷酸池的载体需 4-6 周
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应用

用于 CRISPR 筛选的向导 RNA 文库

CRISPR 筛选涉及基因活性的精确性、高通量敲除、干扰或调节,可揭示复杂的基因型-表型相互作用。寡核苷酸池旨在为每个基因编码多个向导 RNA 分子。

产品优势包括:

  • 完全控制向导文库的设计,避免不必要的向导分子、测序量浪费和有限的每个基因向导比率。
  • 高保真 Cas 酶结合高精度合成,可实现真正的高保真筛选,且将脱靶效应降至最低。
  • 极为均一、无偏差的池可放大信噪比,实现最大化的突变检测,从而降低了下游成本。
  • 高达 300 nt 的寡核苷酸可兼容其他实验元素。根据寡核苷酸、基因组同源性或最少启动子,轻松添加多个向导。

基于单细胞转录组学的新一代 CRISPR 筛选

观看我们的网络研讨会: 基于单细胞转录组学的新一代 CRISPR 筛选

基因组陈列式文库

陈列式文库可对基因组功能进行全面研究。寡核苷酸池可编码肽阵列、mRNA 编码序列或基因组片段。

产品优势包括:

  • 精准陈列基因组的目标区域。在设计步骤中忽略不必要的序列,以此降低实验干扰。
  • 通常无法合成为基因的复杂、重复或回文序列,可以在寡核苷酸中编码。
  • 较大的肽结构或基因组结构可在长度为 300 nt 的寡核苷酸中编码。
  • 均一的合成可最大程度地减少全面筛选所需的过采样。

鉴定用于 RNA 疫苗开发的冠状病毒致病因子

阅读我们的文章: 使用 Twist 寡核苷酸池鉴定用于 RNA 疫苗开发的冠状病毒致病因子

高通量遗传控制筛选

了解控制基因表达和调控的遗传因子已广泛应用于合成生物学和潜在疾病疗法的开发。寡核苷酸池支持遗传控制的高通量筛选,包括基因表达谱分析和报告解读应用。

产品优势包括:

  • 高质量的池确保您可以研究每个碱基的功能
  • 高度均一性意味着您无需进行过多筛选就能找到答案
  • 高达 300 nt 的池使您可以灵活地添加多个元素或同源区域

TechNetworks 上的表观转录组筛选

观看我们的网络研讨会: TechNetworks 上的表观转录组筛选

荧光原位杂交

荧光原位杂交(FISH)可以直接观察到生物样本中核酸的丰度和空间组织情况。寡核苷酸池可以编码与荧光标记结合的探针,从而对大量靶标进行可调整、可编程的可视化。

产品优势包括:

  • 快速的 FISH 探针开发
  • 序列控制可实现有效的靶向定位
  • 更长的寡核苷酸可实现更具体的靶向定位

利用 Nicola Crosetto 方法处理的寡核苷酸池快速高效地生产 FISH 探针

观看我们的网络研讨会: 利用 Nicola Crosetto 方法处理的寡核苷酸池快速高效地生产 FISH 探针

用于 CRISPR 筛选的向导 RNA 文库

CRISPR 筛选涉及基因活性的精确性、高通量敲除、干扰或调节,可揭示复杂的基因型-表型相互作用。寡核苷酸池旨在为每个基因编码多个向导 RNA 分子。

产品优势包括:

  • 完全控制向导文库的设计,避免不必要的向导分子、测序量浪费和有限的每个基因向导比率。
  • 高保真 Cas 酶结合高精度合成,可实现真正的高保真筛选,且将脱靶效应降至最低。
  • 极为均一、无偏差的池可放大信噪比,实现最大化的突变检测,从而降低了下游成本。
  • 高达 300 nt 的寡核苷酸可兼容其他实验元素。根据寡核苷酸、基因组同源性或最少启动子,轻松添加多个向导。

基于单细胞转录组学的新一代 CRISPR 筛选

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基因组陈列式文库

陈列式文库可对基因组功能进行全面研究。寡核苷酸池可编码肽阵列、mRNA 编码序列或基因组片段。

产品优势包括:

  • 精准陈列基因组的目标区域。在设计步骤中忽略不必要的序列,以此降低实验干扰。
  • 通常无法合成为基因的复杂、重复或回文序列,可以在寡核苷酸中编码。
  • 较大的肽结构或基因组结构可在长度为 300 nt 的寡核苷酸中编码。
  • 均一的合成可最大程度地减少全面筛选所需的过采样。

鉴定用于 RNA 疫苗开发的冠状病毒致病因子

阅读我们的文章: 使用 Twist 寡核苷酸池鉴定用于 RNA 疫苗开发的冠状病毒致病因子

高通量遗传控制筛选

了解控制基因表达和调控的遗传因子已广泛应用于合成生物学和潜在疾病疗法的开发。寡核苷酸池支持遗传控制的高通量筛选,包括基因表达谱分析和报告解读应用。

产品优势包括:

  • 高质量的池确保您可以研究每个碱基的功能
  • 高度均一性意味着您无需进行过多筛选就能找到答案
  • 高达 300 nt 的池使您可以灵活地添加多个元素或同源区域

TechNetworks 上的表观转录组筛选

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荧光原位杂交

荧光原位杂交(FISH)可以直接观察到生物样本中核酸的丰度和空间组织情况。寡核苷酸池可以编码与荧光标记结合的探针,从而对大量靶标进行可调整、可编程的可视化。

产品优势包括:

  • 快速的 FISH 探针开发
  • 序列控制可实现有效的靶向定位
  • 更长的寡核苷酸可实现更具体的靶向定位

利用 Nicola Crosetto 方法处理的寡核苷酸池快速高效地生产 FISH 探针

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资源
听听科学家们怎么说
Twist 的 ssDNA 寡核苷酸池具有高均一性、低错误率且长达 300 nt,因此非常适合用于构建混合 RNA 结构。这些特征为筛选 RNA 小分子的相互作用提供了高精度和高效率。
Kaoru R. Komatsu
xFOREST Therapeutics Co., Ltd 代表董事兼首席技术官
我们发现 Twist 寡核苷酸池是一种快速,简便和灵活的途径,可以为我们的研究合成高质量的定制 CRISPR 文库。
Stephen Pettit
英国癌症研究所研究员
我们从事于大规模平行报告基因检测 (MPRA) 的工作,专注于鉴定单碱基取代的基因调控功能,因此高寡核苷酸保真度至关重要。当我们对从 Twist 获得的寡核苷酸池进行测序时,质量令人震惊,突变比我们预期的少了两倍。
Bernie Mulvey
美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院医学博士生

最后,如何轻松订购 DNA

 

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