“加急基因”的序列接受标准是什么?

在 300 bp 至 5000 bp 之间且被我们的筛选器评分为“标准”复杂性的所有克隆基因序列均满足加急服务的条件。

我们的评分系统利用机器学习模型分析并结合多个序列参数(即总 GC 百分比、最大均聚物长度、最大重复长度、序列长度、重复密度等)。该模型使用我们的历史制造数据进行打磨,它可以更精确地估计基因和抗体产品的生产成功率。

重复结构和极端 GC 含量是复杂问题的主要影响因素。序列设计指南可在线获取,如下所示:

  • 避免 ≥ 20 bp 或 Tm ≥ 60 C 的重复序列 
  • 全局 GC 含量必须介于 25% 和 65% 之间
  • 避免基因内部 GC 含量差异过大(即最高和最低 50 bp 延伸片段之间的 GC 含量差异应不大于 52%)
  • 尽量减少均聚物
  • 最小化分散在整个序列中的小片段重复序列的数量/长度
  • 对于 HIS 标签,需将 CAC 和 CAT 密码子结合使用,即 CACCAT

限制重复次数和降低 GC 含量可提高序列被接受的可能性。例如:总 GC 含量为 66% 的基因可能会被评为“不接受”,但当 GC 含量降低到 65% 或更低时,可能会被作为 “复杂”序列接受。进一步将 GC 含量降低至约 60% 或更低可能会将复杂性分数提高至“标准”,此时该序列将满足加急服务的条件。这同样有利于消除重复序列、减少均聚物延伸以及消除 GC 窗口中的极端基因突变。基因中可以避免或减少的此类结构越多,就越有可能满足加急服务的条件。

有关我们的评分算法和序列设计的更多信息,请访问我们的常见问答

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