这种缺失发生在具有 10 个连续 T 的基因组环境中的基因 ATM 中。这些连续的 T 使基因座成为一个“滑动”序列，DNA 聚合酶在复制基因组拷贝时，模板链会相对于正在合成的链发生滑动，进而产生 INDEL。

 

在文库预处理 PCR 过程中，当 PCR 聚合酶复制序列时，也很有可能通过相同的机制产生同样的效果。因此，在普通文库预处理过程中，由于 PCR 循环，此基因座特别容易自发形成变异体序列。

 

当等位基因完全不存在时，任何人类基因组样本（包括泛癌种参考标准品）均会因 PCR 错误而显示该突变的 VAF 升高。（在泛癌种 0% VAF 中，它的 VAF 值高于标准中 99.8% 的其他变异体位点。）因此，由于基因组环境，背景噪声较高，这意味着由于序列竞争，该变异体的空白限 (LoB) 可能高于其他基因座。

 

当等位基因存在时，真正的等位基因频率将 “附加”到基因座的噪声水平“之上”，这意味着该变异体的检测限（LoD）可能高于其他变异位点。

 

使用 UMI 接头（如 Twist UMI 接头）并运行共识崩塌和/或双链崩塌，有助于减少文库预处理中 PCR 误差导致的该位点的噪音。